本作的主人公是一位名叫津崎青叶的女孩，她明亮开朗，富有朝气。某天，津崎青叶突然被神秘人士绑架，并被带到南美洲委内瑞拉一个叫做“天使”的组织里。在那里在，津崎青叶被迫成为了叫做“人机”的巨型机器人兵器的驾驶员。而青叶的好朋友黄坂露伊，也作为莫利比特2号操纵者被一起卷进了战斗中。
三年之后，世界各地都出现了瞬间将整个城市毁灭的可怕事件，实际上，这是一个名为基姆的组织使用“人机”对世界各地进行攻击所造成的。为此，“天使”展开了对该组织的追击。另一方面，在日本东京，失去了三年前全部记忆的女孩赤绪为了保卫朋友们，加入了“天使”，同基姆展开了战斗……